柯南射出量子足球，试图阻挡熵能钻头，然而球体在接触熵能的瞬间分解成无数个绝望的残影，每一个残影都预示着失败的结局。灰原哀启动融合了圣树本源力量的“曙光方程式”，设备表面的晶体迸发出耀眼的光芒，但熵寂余烬形成的逆矩阵如同一个巨大的漩涡，不断抵消着装置的能量输出。希望在一点点消逝，绝望如同潮水般涌上心头。
千钧一发之际，灰原哀突然注意到方舟仪表盘上，一枚未被污染的光粒正在闪烁。那光粒虽小，却散发着纯净而温暖的光芒，仿佛是黑暗中的萤火，给人带来一丝希望。那是来自圣树最纯净的种子，蕴含着创生与希望的原始代码，是最后的救命稻草。
与此同时，地球上的“希望灯塔”计划进入背水一战。全球人类齐心协力，将最后的意识能量注入特制的量子发射器。从繁华的都市到偏远的乡村，从高楼大厦到简陋的小屋，无数人闭上眼睛，将自己的信念、勇气和爱化作金色的能量。无数道金色光柱直冲云霄，在大气层外汇聚成巨大的希望之盾，光芒照亮了整个天空，给人以无限的力量。
柯南和灰原哀将光粒种子与曙光方程式连接，借助人类集体意识的增幅，引爆了蕴含在种子中的创生力量。金色的光芒如创世之火，瞬间点燃了被污染的光粒。光芒所到之处，熵能纷纷消散，黑暗被驱散。在意识与熵能的终极碰撞中，倒悬巨塔开始逆向崩解，发出震耳欲聋的轰鸣。被腐化的根系重新焕发出金色生机，圣树的光芒再次照亮了整个宇宙。黑衣组织首领发出不甘的怒吼，他的身体在光芒中化作无数暗紫色的碎片，消散前，最后一块碎片飞向宇宙深处，在那里与某个未知的存在产生了量子纠缠，仿佛预示着新的危机。
当方舟重返现实，米花市的天空重新洒满金色光辉，街道上的金色藤蔓恢复了生机，散发着温暖的光芒。人们欢呼雀跃，庆祝这来之不易的胜利。但灰原哀知道，真正的危机尚未解除——在超深空的某个维度裂缝中，一个由熵寂余烬与黑衣组织科技融合的恐怖存在正在孕育，如同一只蛰伏的巨兽，等待着下一次的爆发。柯南握紧侦探徽章，目光坚定地望向远方：“只要量子圣树还在，我们就有守护希望的力量。无论前方有多少艰难险阻，我们都不会退缩。”而在宇宙的黑暗角落，一双由熵能构成的巨眼缓缓睁开，猩红的光芒中充满了杀意与贪婪，新一轮关乎所有平行世界存亡的较量，已然拉开帷幕。
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