修昔底德还深入研究了战争中的宗教因素。他与雅典的祭司们交谈，祭司们表示：“战争前，我们曾进行占卜，占卜结果显示战争胜负难料，但雅典民众在宗教狂热的驱使下，认为神会站在他们一边，更加积极地推动战争的爆发。而战争中，一些不祥的征兆被视为神的警示，但雅典的领导者们却不知如何应对，导致军心民心惶惶。有一次，战场上突然出现日食，士兵们都认为这是神的愤怒，吓得不敢作战。祭司们也不知所措，只能让士兵们祈祷赎罪，但这并没有改变战场上的局势。当时，民众们聚集在神庙前，要求祭司解释为什么神会降下这样的征兆，祭司们只能含糊其辞，说这是对雅典人某些行为的不满，要大家更加虔诚地祭祀，但这并没有安抚住民众的恐慌情绪。”
斯巴达的宗教人士也有类似的说法：“我们斯巴达尊崇战神阿瑞斯，战争开始时，认为阿瑞斯会赐予我们胜利。但随着战争的推进，一些意外的失败让士兵们开始怀疑神的旨意，这对他们的士气产生了很大的影响。我曾见到一位斯巴达士兵在战败后，对着阿瑞斯的神像怒吼，质问神为何抛弃他们。还有一次，祭祀战神的仪式上，圣物突然起火，士兵们都认为这是不祥之兆，军心大乱。在那之后，士兵们的战斗意志明显下降，他们觉得神不再眷顾斯巴达，自己的战斗变得没有意义。”
尽管他最终未能完成这部巨着便与世长辞，但他留下的文字，成为了后人研究古希腊历史的宝贵财富。他的着作以其严谨的态度和深刻的洞察力，为他赢得了“历史科学”之父的美誉。
而“修昔底德陷阱”的提出，更是让他在国际关系研究领域永载史册，不断引发着后人对大国关系的思考与探索。
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