2241年，银河系边缘的“大麦哲伦星云情报监测站”传来紧急警报——机械虫族的先遣舰队已抵达星云边缘，正在突破联盟的第一道防御线。监测站传回的影像显示，机械虫族的战舰比十年前更加先进，舰体覆盖着能吸收能量的“暗物质装甲”，武器系统也升级为能摧毁防御塔的“反物质炮”。
联盟紧急召开防御会议，周星辰作为联盟防御计划总协调官，站在全息沙盘前，分析着机械虫族的进攻态势：“机械虫族此次派出了500艘战舰，分为三个梯队，分别攻击第一道防御线的东、中、西三个区域。它们的目标很明确，就是突破大麦哲伦星云防御线，直取银河系核心区域。”
绿星族的莉娅忧心忡忡地说：“我们的防御塔能量武器对暗物质装甲的效果有限，第一道防御线可能撑不了多久。”
水晶族的泽恩补充道：“我们的晶体能量炮虽然能击穿暗物质装甲，但需要充能时间，无法应对机械虫族的密集攻击。”
周星辰沉思片刻，提出了新的防御方案：“启动‘生命防线计划’——将生命技术与防御系统结合，用‘活体防御塔’替代传统的金属防御塔，用‘意识操控武器’替代自动化武器系统。”
“活体防御塔”是联盟最新研发的防御设施，利用绿星族的生命能量技术，将特殊的植物与晶体融合，培育出具有自我修复能力的“防御植物”。这种植物的枝干能释放出强大的能量光束，叶片能形成能量护盾，根系则能深入行星内部，吸收行星的能量作为动力，即使被摧毁一部分，也能快速再生。
“意识操控武器”则是基于意识融合技术研发的武器系统。操作员通过意识连接，直接操控武器的瞄准、发射与能量调节，反应速度比自动化系统快三倍，能更精准地攻击机械虫族的弱点。
防御方案得到了联盟成员的一致同意。各文明立刻行动起来：绿星族的植物培育专家前往大麦哲伦星云，加速活体防御塔的培育；水晶族的晶体工匠负责为意识操控武器打造核心部件；人类与暗星文明的士兵则接受意识操控训练，准备登上防御阵地。
2241年6月，机械虫族的先遣舰队对第一道防御线发起总攻。无数艘战舰朝着防御线冲来，反物质炮的炮火像黑色的暴雨，砸向联盟的防御塔。传统的金属防御塔在炮火中纷纷倒塌，但活体防御塔却展现出强大的生命力——被击中的枝干快速再生，叶片形成的能量护盾挡住了大部分炮火，根系吸收的行星能量让能量光束的威力不断增强。
“启动意识操控武器！”周星辰下令。防御阵地上，1000名经过训练的操作员同时连接意识操控系统，无数道彩色的能量光束从活体防御塔中射出，精准地击中机械虫族战舰的暗物质装甲薄弱部位。一艘艘机械虫族战舰在能量光束的攻击下失去动力，漂浮在宇宙中。
机械虫族的指挥官见状，立刻调整战术，派出“机械虫群”——一种体型小巧、数量庞大的机械生物，它们能附着在防御塔上，通过啃噬植物组织破坏防御塔。
“启动‘生命共生系统’！”莉娅大喊。活体防御塔的叶片中，释放出大量的“共生微生物”，这些微生物能附着在机械虫群上，分解它们的金属结构，同时为防御塔提供额外的能量。很快，机械虫群就在共生微生物的作用下纷纷解体，成为活体防御塔的“养料”。
战斗持续了三天三夜，联盟最终击退了机械虫族的先遣舰队，守住了第一道防御线。但联盟也付出了沉重的代价——500座活体防御塔被摧毁，200名意识操控操作员因意识过载而受伤。
“机械虫族的实力远超我们的预期。”周星辰在战后总结会议上说，“它们通过吸收被征服文明的技术，不断进化，我们必须加快防御系统的升级，同时寻找反击的机会。”
会议决定，启动“生命武器研发计划”——基于原初生命实验室的研究成果，培育具有攻击性但可控的“防御生命”，用于对抗机械虫族；同时，派遣联合侦察舰队，深入机械虫族的控制区域，收集它们的技术情报，寻找它们的弱点。
2242年，“生命武器研发计划”取得重大突破。联盟培育出一种名为“星尘卫士”的防御生命——它们呈球形，表面覆盖着能吸收宇宙辐射的星尘颗粒，内部蕴含着强大的能量，能通过自爆的方式摧毁机械虫族的战舰，但自爆前会发出特殊的信号，让联盟的部队有足够的时间撤离。
同年，联合侦察舰队传回重要情报：机械虫族的核心母舰位于三角座星系的“黑洞工厂”——一座围绕黑洞建造的巨大工厂，机械虫族通过黑洞的能量，快速生产战舰与机械生物。工厂的核心是一台“暗物质核心”，只要摧毁这台核心，机械虫族的生产能力就会大幅下降。
联盟决定，发起“黑洞突袭行动”——派遣一支精锐的突击舰队，突破机械虫族的封锁，摧毁黑洞工厂的暗物质核心。周星辰亲自担任突击舰队的总指挥，陈玥则负责意识操控系统的技术支持，莉娅与泽恩分别带领绿星族与水晶族的部队，配合突击行动。
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