丁卯日，李世民进入宫城，命令记室房玄龄先进入中书省、门下省，收集隋朝的图籍制诏，已经被王世充毁坏，没有收获。命令萧瑀、窦轨等人查封府库，收集金帛，赏赐将士。收捕王世充的党羽中罪行特别严重的段达、王隆、崔洪丹、薛德音、杨汪、孟孝义、单雄信、杨公卿、郭什柱、郭士衡、董叡、张童儿、王德仁、朱粲、郭善才等十几人，在洛水之上斩首（胡三省注：《新书》说：薛德音因为移送檄文傲慢无礼，崔弘丹因为制造弩箭伤害很多士兵，先诛杀他们；接着收捕段达等人在洛水边斩首。司马光避国讳，改弘丹为洪丹。郭什柱应该作“什住”）。起初，李世积和单雄信友好，发誓同生共死。等到洛阳平定，李世积说单雄信骁健绝伦，请求用自己的全部官爵来赎他，李世民不允许（胡三省注：《旧传》说“高祖不允许”。按太宗攻下洛阳就诛杀单雄信，何曾向高祖请示，大概是太宗时的史臣叙述高祖时的事情，有杀戮不得人心的，都说是高祖的命令，掩盖太宗的过失，比如屠杀夏县之类都是这样）。李世积坚决请求没能得到，哭泣着退下。单雄信说：“我早就知道你办不成事。”李世积说：“我不惜余生，想和兄长一起死；但既然已经把这身交给国家，事情不能两全。况且我死之后，谁来照顾兄长的妻子儿女呢？”于是割下大腿的肉给单雄信吃，说：“让这块肉随兄长化为尘土，或许不辜负过去的誓言！”士民痛恨朱粲残忍，争相投瓦砾击打他的尸体，很快堆成了坟冢。囚禁韦节、杨续、长孙安世等十几人送往长安。士民中被王世充无辜囚禁的，都释放了，被王世充杀死的人，祭祀并哀悼他们（古代卿大夫去世，君主命令有关官员汇总他的功德，写文章哀悼，称为诔。现在哀悼他们，是因为他们无罪而死）。
起初，秦王府属杜如晦的叔父杜淹侍奉王世充。杜淹一向和杜如晦兄弟不和，诬陷杜如晦的哥哥并杀了他，又囚禁杜如晦的弟弟杜楚客，差点饿死，杜楚客始终没有怨恨的神色。等到洛阳平定，杜淹应当处死，杜楚客哭泣着请求杜如晦救他，杜如晦不听。杜楚客说：“过去叔父已经杀了哥哥，现在哥哥又要杀叔父，一门之内，自相残杀殆尽，难道不令人痛心吗！”想要自刎，杜如晦才为他向李世民请求，杜淹得以免死。
秦王李世民坐在阊阖门（晋朝定都洛阳，城西面北来第三门叫阊阖。隋朝营建新都，《唐六典》记载的都城、皇城、宫城、苑城各门，都没有阊阖，大概是唐朝改的名称），苏威请求拜见，自称年老有病不能下拜。李世民派人责备他说：“你是隋朝的宰相，国家危难不能扶持，导致君主被弑、国家灭亡。见了李密、王世充都下拜舞蹈。现在既然年老有病，就不必劳烦相见了。”等到苏威到长安，又请求拜见，不被允许。苏威又老又穷，没有官爵，死在家里，享年八十二岁（史书记载苏威的长寿不如早死）。
秦王李世民观看隋朝宫殿，叹息说：“放纵奢侈之心，穷尽百姓欲望，怎么会不灭亡呢！”下令拆除端门楼，焚毁乾阳殿，毁坏则天门及阙（《唐六典》记载：东都皇城南面三门，中间是端门。乾阳殿，唐朝后来在原址建乾元殿。宫城南面三门，中间是应天门，大概是隋朝的则天门。《唐六典》说：毁坏建国门。《隋志》记载：东都城南面二门，正南是建国门）；废除各道场，城中的僧尼，留下有名望德行的各三十人，其余都恢复世俗身份（返初服）。
17前真定令周法明（真定县，隋朝属恒山郡，唐朝改郡为恒州），是周法尚的弟弟（周法尚从陈朝进入隋朝担任将领）。隋朝末年聚集宾客，袭据黄梅（《隋志》记载：黄梅县旧称永兴，开皇初改叫新蔡，十八年改叫黄梅，因黄梅山得名。刘昫说：黄梅是汉代蕲春县地，刘宋分设新蔡郡，隋朝为县，属蕲春郡），派族子周孝节攻打蕲春（蕲春，汉代县名，属江夏郡，吴为蕲春郡，晋改为西阳，又改为蕲阳，梁改叫蕲水，后齐改叫齐昌，隋开皇十八年恢复叫蕲春，是郡治所），侄子周绍则攻打安陆（安陆，汉代县名，属江夏郡。刘宋分设安陆郡，梁设南司州，西魏设安州，隋恢复为安陆郡），儿子周绍德攻打沔阳（沔阳，汉代竟陵县地，属江夏郡，后周设复州，大业初改沔州，不久改沔阳郡，），都攻克了。庚午日，周法明以这四郡前来投降。
18壬申日，齐善行献洺、相（今河南安阳）、魏（今河北大名）等州前来投降（胡三省注：《革命记》说：“五月七日，善行等人到洺州。”《实录》说“壬申日，洺、相、魏等州投降”，大概是投降的使者到达的日子。月末又说“裴矩等献八玺投降”，大概是玺到达的日子）。当时窦建德的残余部众逃到洺州，想立窦建德的养子为主，征兵抵抗唐军；又想抢劫居民，返回海边做强盗。齐善行独自认为不行，说：“隋朝末年战乱，所以我们在民间聚集，只是想求生罢了。凭夏王的英武，平定河朔，兵马强盛，一旦被擒，易如反掌，难道不是天命有所归属，不是人力能争夺的吗！现在失败到这种地步，坚守也不成，逃跑也不免一死，同样是亡国，怎能再给百姓留下祸害！不如诚心向唐朝请降，一定要获取丝帛的，应当散尽府库的财物，不要残害百姓！”于是运送府库中的几十万段丝帛，放在万春宫东街（万春宫是窦建德所筑），来分发给将士，总共用了三天三夜才分完。又派兵守卫街巷，得到财物的人就离开，不准再进入百姓家。士兵散尽后，齐善行和仆射裴矩、行台曹旦，率领百官奉窦建德的妻子曹氏和传国八玺以及打败宇文化及所得的珍宝向唐朝投降（武德二年，窦建德打败宇文化及，得到八玺和珍宝）。唐高祖任命齐善行为秦王左二护军（秦王所统辖的设置左三府、右三府，各有统军、护军），并厚赏他。
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