“我叫小智，这是小刚、小霞，还有我们的宝可梦！” 小智笑着介绍，“我们也是偶然在浅滩岛遇到波加曼的，能帮你们团聚太好了！”
小悠邀请大家坐在赛场边的观众席上，还买了冰镇的果汁递给他们。闲聊中，大家得知小悠是 Sinnoh 地区的训练家，这次来丰缘是为了参加下个月的华丽大型庆典，顺便参加各地的水系比赛，提升波加曼的实力。
“对了，小悠，你在凯那市有没有见过暗骨组织的人？” 小刚突然问道，“就是穿着黑衣服、印着骷髅标志的人，他们会伤害野生宝可梦。”
小悠的脸色变了变：“我见过！昨天我在港口附近的礁石区训练波加曼时，看到几个黑衣人在给野生的毒刺水母注射什么东西，那些毒刺水母后来变得特别暴躁，差点攻击我和波加曼。我想告诉君莎小姐，可等我回去找的时候，他们已经不见了。”
超梦立刻站起身：“你能带我去那个礁石区吗？我想看看那里的能量残留。”
“当然可以！” 小悠点头，“不过比赛还有半小时就要开始了，波加曼……”
波加曼立刻跳到小悠面前，“波加” 叫着，还拍了拍自己的胸脯，像是在说 “比赛重要，我能照顾好自己，你先去帮大家”。小悠笑着摸了摸它的脑袋：“那我先带你们去礁石区，很快就回来。”
众人跟着小悠往港口西北方向走，大约十分钟后，来到一片偏僻的礁石区。这里的海水比其他地方浑浊一些，偶尔能看到几只毒刺水母快速游过，眼神里带着一丝警惕。
超梦闭上眼睛，双手微微抬起，周围的能量开始汇聚。过了一会儿，它睁开眼，脸色凝重：“这里有暗骨组织的能量残留，还有一种陌生的化学物质，和水之都工厂里的物质很像，但毒性更强。那些毒刺水母应该是被注射了这种物质，才会变得暴躁。”
拉蒂亚斯也从远处飞回来，对着超梦叫了几声。超梦翻译道：“拉蒂亚斯在附近的废弃仓库里，发现了暗骨组织留下的实验装置，还有一些装着黑色液体的瓶子，应该就是他们用来注射宝可梦的药剂。”
“我们去仓库看看！” 小智立刻说道。
跟着拉蒂亚斯来到仓库，里面弥漫着一股刺鼻的气味。地上散落着几个破碎的黑色瓶子，液体流在地上，还在冒着细小的气泡。墙角放着一台生锈的机器，上面印着暗骨组织的骷髅标志，机器旁边还有几张实验记录，上面写着 “水系宝可梦强化实验 —— 第 3 阶段”。
“这些人竟然把宝可梦当作实验品！” 小霞气愤地攥紧拳头，“太过分了！”
小刚捡起一张实验记录，仔细看了看：“上面写着，他们想通过注射药剂，让水系宝可梦变得更强大，然后控制它们去破坏丰缘的水系生态，好像是为了找到什么‘深海能量源’。”
“深海能量源？” 超梦皱眉，“难道和盖欧卡有关？盖欧卡沉睡在深海，能控制海洋的能量，如果暗骨组织想利用它，后果不堪设想。”
就在这时，仓库外传来脚步声，还有人说话的声音：“快点，把剩下的药剂搬到船上，老大说要去下一个据点，继续找毒刺水母做实验。”
“是暗骨组织的人！” 小智立刻压低声音，“大家躲起来，等他们进来就动手！”
众人迅速躲到仓库的货架后面，皮卡丘绷紧身体，尾巴上冒出微弱的电流；波加曼（小悠刚才担心它，也带过来了）则屏住呼吸，紧紧贴着小悠的腿；超梦和拉蒂亚斯做好了战斗准备，眼神警惕地盯着门口。
三个黑衣人推开门，扛着箱子走进来，丝毫没有察觉到仓库里有人。为首的黑衣人放下箱子，不耐烦地说：“快点搬，别耽误了时间，要是被君莎小姐发现就麻烦了。”
“就是现在！” 小智大喊一声，从货架后跳出来，“皮卡丘，十万伏特！”
皮卡丘纵身跃起，黄色的电流从尾巴射出，精准地击中了三个黑衣人手中的箱子。箱子瞬间炸开，黑色的液体流了一地，散发出更刺鼻的气味。
黑衣人吓了一跳，转头看到小智一行，立刻拿出电击棒：“又是你们这些多管闲事的家伙！上次在水之都让你们跑了，这次别想再逃！”
“谁要逃了！” 小霞放出宝石海星，“宝石海星，用水炮！”
宝石海星从精灵球里出来，立刻喷出一道强劲的水柱，朝着黑衣人射去。黑衣人连忙躲闪，却被超梦用精神强念定在原地，动弹不得。
“说！你们的老大是谁？想找深海能量源做什么？” 超梦冷声问道。
为首的黑衣人咬着牙，不肯说话。就在这时，仓库外传来汽车发动的声音，拉蒂欧斯突然飞进来，对着超梦叫了几声。
“不好，他们的同伙要跑了！” 超梦立刻松开黑衣人，和拉蒂欧斯一起追了出去。只见一辆黑色的货车正朝着码头的方向驶去，车后箱还装着几个大箱子。
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