进入五月，神宗的病情突然加重，他为此而大赦天下希望以此为自己祈福。就在此时，病中的他得报王安石也突发重疾，他为此而忧心不已特命御医前往诊治。如果可能，神宗当然希望能够与分别近十年的王安石再度相会，但王安石没有文彦博那样的一副好身板且远在长江之畔的金陵。他们君臣二人之间的缘分早在十年前就已经尽了，此后的这些岁月里他们之间只有对彼此的无限牵挂和祝福。
此后的半年时间里，神宗将主要的精力都用在了对西夏的经略上。元丰西征和永乐之战始终是他心里永远的痛，而这种痛只有一个人的死才能让他得到缓解，那人便是仁多伶仃。神宗就像是憋着一口气似的，仁多伶仃不死他的这口气就永远顺不过来，而他也将无颜去面对自己的列祖列宗。
仁多伶仃终于在这年的十月被宋军阵斩，这个消息让神宗大喜过望，但这也好像是耗尽了神宗的最后一口元气。随着他的一声长叹，困扰他长达数年的一颗心结也终于散了，但这个心结的散开却又像是癌细胞的一次大扩散，神宗的健康状况就此急剧恶化。
正如我们之前所言，在神宗的生命渐入谷底之时，宋朝的国运却如旭日高升一般让人炫目。这年十二月，另一个让神宗大喜的消息传来——由司马光担任总编修官、由刘恕、刘攽、范祖禹担任主编、前后历时近二十年编修的《资治通鉴》终于书成。虽然这部史学巨着是由宋英宗下令编修的，但它刚起步英宗就驾崩了，真正为这部书保驾护航的是神宗，而且神宗在这二十年间也给予了司马光等人巨大的人力和财力资助，因而这一枚史学勋章里显然也有神宗的一份功劳。
一点也不夸张地说，如果朱棣因为《永乐大典》，乾隆因为《四库全书》而被世人称颂，那么神宗也该得到同等的殊荣。
可是，有一个现象很奇怪，这就是我们当时介绍这部书的时候所提到的：只要一提到《永乐大典》和《四库全书》我们瞬间想到的是朱棣和乾隆，可一提到《资治通鉴》我们所想到的人却只有司马光。这是为什么？如果司马光像司马迁那样是他独立完成了一部史学巨着，那么他得此高名显然无可厚非，可事实上他只是总编修官。你能想象解缙敢在《永乐大典》上压朱棣一头吗？大名如纪晓岚也没能在《四库全书》上压乾隆一头，可司马光就是活生生地在《资治通鉴》上把包括皇帝在内的人都秒杀得毫无存在感。宋代是文官的天堂，此诚不欺也，如此也可见掌握笔杆子和话语权是有多么的重要。
发了几句牢骚，接下来还是来说神宗的接班人问题。
由于深感自己已经越来越精力不济，在宰相蔡确的建议下，神宗决定在次年春天正式册立赵佣为皇太子，而且他连赵佣的老师都找好了。然而，神宗为赵佣选的这两名老师让变法派不禁是大跌眼镜——司马光和吕公着。
直到这生命的尽头，神宗还是不改其理想主义者的本色。他这样做没有别的意思，他只是希望司马光和吕公着这两个学识渊博且以德行隆重而闻名中外的老臣能够为了大宋的未来发展而摒弃党派和意识形态之争。可悲的是，司马光和吕公着注定要让他大失所望，甚至是让他在九泉之下再度为自己的这个决定而痛哭流涕。更可悲的是，不但是司马光和吕公着，就连身为变法派的蔡确也很快将会让他失望——如果他知道蔡确都背着他做了什么的话。
时间进入公元1085年正月，神宗迎来了他生命的最后一段旅程。在此后的两个月时间里他几乎一直卧床不起，直到他在这年的三月五日驾崩于福宁殿。
当神宗病重而不能视朝的消息传出后，朝廷内外顿时舆情汹汹。这里面最重要的原因就在于此时的皇太子还未册立，而神宗的两个亲弟弟雍王赵颢和曹王赵頵就此成为了皇位的有力竞争者，宋朝的国本由此而不稳。既然如此，当初受命并发誓要拥立小皇子继位的蔡确为什么不赶快将赵佣扶上太子宝座呢？因为蔡确在这个节骨眼上突然动摇了，而他之所以动摇则是受了一个此时只是在馆阁里担任历史馆检校的小官邢恕的蛊惑。
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