在收集完线索后，主角发现这些线索指向了一个偏远的星系。他向地球高层和外星文明代表汇报了情况，三方决定一同派遣精英力量前去围剿。
到达那个星系后，发现一颗巨大的行星被一层强大的力场保护着，这里便是神秘势力的总部。主角等人费了好大劲才突破力场。
进入总部内部，到处都是奇形怪状的高科技设备。他们遭遇了神秘势力的重重阻拦，但凭借各方的能力协作前进。
在最核心的区域，主角看到了一个巨大的能量反应堆，旁边站着一个全身笼罩在黑袍中的首领。原来这个神秘势力妄图统治宇宙，认为其他生命形式低等。
主角等人与首领及手下展开最后的决战。关键时刻，主角发现了反应堆的弱点，他设法引导外星文明和地球联军一起攻击，引发连锁反应。随着一声巨响，神秘势力的总部被炸成齑粉，首领也灰飞烟灭。危机解除，宇宙重归平静，主角成为了当之无愧的英雄，继续守护宇宙和平。
数年后，主角依然坚守着自己守护宇宙和平的职责。一天，他在巡逻时发现一个小型黑洞附近有异常的能量波动。他小心靠近查看，发现竟然是神秘势力残留的一小股力量正在利用黑洞的能量进行某种危险实验。这股势力打算创造一个能够扭曲时空的通道，若成功，他们就能穿越到过去改变历史，重新崛起。
主角深知不能让他们得逞，于是独自潜入他们的据点。他利用智慧再次破解重重机关来到核心区。但这次敌人早有防备，设下陷阱困住了他。就在千钧一发之际，曾经被他拯救的外星文明及时赶到，救了他并协助他摧毁了这个危险的实验设施。
经此一役，主角更加明白守护宇宙和平任重道远。他联合宇宙各文明建立起一个更为严密的监控体系，以确保不会再出现类似的威胁。此后，主角依然时刻警惕着，在宇宙各处留下他守护和平的身影。
在建立起严密的监控体系后，主角并没有放松。一日，监控体系传来警报，显示在一处星云中有未知的能量聚集。主角立刻驾驶飞船前往探查。到达星云附近，他发现这里出现了许多未曾见过的晶体结构，散发着幽冷的光。
主角穿上防护服走进其中一个较大的晶体建筑。里面的空间广阔而深邃，墙壁上有着各种各样的图案和符号，似乎在诉说着古老的故事。在建筑的中心，他发现了一块巨大的水晶，水晶中封存着一团黑色的物质。
突然，周围涌出许多机械傀儡，它们朝着主角发动攻击。主角一边躲避，一边寻找这些傀儡的控制源头。经过一番周旋，他发现只要破坏水晶周围的几个能量节点就能停止傀儡的行动。
主角成功破坏节点后，傀儡全部倒下。他进一步研究那块水晶中的黑色物质，发现这竟是神秘势力遗留的一种特殊能源，可以干扰意识。主角深知绝不能让其落入歹人之手，于是他利用飞船上的设备将水晶和黑色物质运送到宇宙深处，用恒星的高温将其销毁。从此，主角继续他的巡逻之旅，永远守护着宇宙的和平。
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