华纳觉得《黑客帝国》回归美国开拍，应该重新办一个开机发布会。顺应颁奖季的东风，让电影更受关注。陈天都拒绝了华纳的提议，没有邀请跟通知任何媒体，因为他认为没有那个必要。
他认为这部电影在拍摄完成之前，再好的宣传也无法留住人气。还不如在电影拍摄了一半或将要完成时开始发力，一来不会增加电影主创人员的心理压力，二来也给他留出了足够的时间布置宣传策划。
因为飞船内的戏份，陈天都是需要剃光头的，所以率先拍摄的是“母体”内、也就是纽约大都会里的戏份。不少人在此期间，也看到了矩阵数码特效公司准备的庞大飞船道具，还有多种造型奇特的机械乌贼，以及庞大的枪械库道具，都惊诧不小。
可这部分镜头拍摄还需要等待，复工的第一天就是拍摄夜戏——雨中追逐，这也是原作中没有的情节。这部分镜头，需要实景和蓝幕搭配拍摄。
搭景、蓝幕、模型、数字天光画等镜头越来越多。为了满足抠像的要求，演员需要在蓝幕的摄影棚内拍摄，因为在蓝幕棚内，没有场景，全靠演员想象，还要求表演的情绪动作与合成的画面中场景相符合，这无疑是对演员经历和表演功底的一个挑战。
而且对照明、道具的要求与传统的拍摄的要求不一样：灯光人员要结合将要合成的背景光线、环境变化包括风雨雷电，设计摄影棚内的灯光，道具的某些部分也会隐藏在蓝布中，在制作中也需要和要合成的道具天衣无缝的结合在一起。
对置景和道具人员的要求并不仅仅是做一些实物的模型了，而是要在计算机中画出所需场景和道具，以便后期合成使用。前期工作完成后，后期合成处理，完全使用了计算机技术，原有的遮片、叠影等传统方式的特效方法被计算机软件的某些功能所取代。
由于统筹师已经把今天要拍的内容给演员们宣布了，陈天都便乐得轻松，只是将这场戏的主要演员聚到一起，为他们简单介绍一个自己各自主演的角色跟注意事项。
“八爷，再检查一遍威亚，道具清场干净，三分钟后准备开拍。”陈天都用大喇叭喊道。
然后走到摄影师艾曼－卢贝兹基身旁叮嘱，“一会凯特从高空跃下，你着重抓一下她跳下时披风扬起的瞬间和落地时往上的仰视镜头，伶俐感，你懂我的意思吗？”
艾曼比了个ok的手势。
陈天都点了点头，又看向正在做最后准备的凯特，“凯特，怎么样？”
“等等，我落地的时候，需要翻滚一下吗？”凯特赶紧问道。
“不需要，膝盖稍微弯曲一下，就行了。怎么酷怎么来，要记住你是很酷的。”
“ok，我是很酷的。”凯特深呼吸一口气，双手握枪，半蹲在高空。一身黑色紧身皮衣披风半拖在地上、半吊在空中，简直是夜之女神的化身。不少小伙子已经挪不开眼睛了。
陈天都笑了笑，比了个手势。
场记顿时大声喊道：“雨中追逐第一幕第一场！”
雨夜，电闪雷鸣，只见镜头中短发微扬的凯特一手倒提手枪，一手端着望远镜，俯瞰建筑物下来往匆匆的行人，耳朵上挂着无限通话耳麦。
影片正常剪辑下，观众会看到凯特正在监视的，是街道一角的一处电子大楼动静，陈天都饰演的尼奥正在那里撬开地缆线，鬼祟的剪短接口，然后接入自己的电脑中，偷入这栋大楼的内部传输网络中，利用黑客技术盗取商业信息。
崔妮蒂：“一切都正常吗？我感到不同寻常的气息。”
幕后观察员，“我的工作还轮不到你来插手。”
崔妮蒂：“说的也是，不过总想来当当班。”
“你喜欢上他了，想来守护他？”
“别胡说，我的任务是找到他，墨菲斯认为他是救世主。”
“你呢，你也这么认为。”
“我的看法无关紧要。”
“你想说，你不这么认为？”
“滋~~”忽然一声杂音，让凯特感到不安，“你听到了吗？这条线路你敢担保没被人动手脚？”“当然能保证，怎么了？”
然后镜头稍移，会看到取款机附近几条街上已经人迹罕至，四周已经埋伏了一圈警察，十数量警车的警灯不停在暗处闪烁，却没有发出一丝声音。
“糟糕，附近有大量警察，有电脑人存在。他不该引起电脑人注意的，唯一的解释，是我们被监听了。”
“轰隆~~”一声雷电轰鸣，正在警察要行动之际，凯特忽然从高空建筑物上一跃而下。披风随风扬起，稳稳落在地上，随即抬步走开，附近行人连反应都没有一个。
“cut。”陈天都大喊一声。
远处机械臂上操纵着摄影机的艾曼朝他挥了挥拳头，示意自己抓拍的非常好。陈天都笑了笑，竖起一根大拇指，然后站起来拍了拍手，喊道：“凯特，这个镜头很好，一次性通过。我们准备转移目的地，去外景拍摄下一个镜头。”
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