见窝阔台可以自如行走，拖雷就起身告辞了。几天后盛夏酷暑，在行军途中，拖雷竟然莫名其妙的离世了，窝阔台乘机将拖雷的军队收归自己手中，剪除托雷家族的威胁。
1233年六月，金哀宗从归德逃奔蔡州，蒙古将领塔察儿率部围攻，因军中缺粮，将士困惫，蒙古要求南宋联合攻打。南宋朝廷皇帝认为向金复仇的机会来了，于是派出2万军队，送粮30万石，帮助蒙古攻蔡州。在宋蒙军队的南北夹攻下，金国腹背受敌。
1234年春，宋军攻破南城，蒙古军攻破西城，金哀宗在幽兰轩自缢而死，金国灭亡，一直憋屈的南宋总算出了一口恶气，可蒙宋两国的“友好”关系并没有维持多长时间。
1239年，拔都率领的“长子西征”大军灭十余万灭掉了钦察、不里阿耳等国，窝阔台命贵由、蒙哥返回蒙古本土。
拔都部也回驻也的里河下游，在那里张幕庆功。席间，拔都自恃年长，开宴时先饮一二盏酒。贵由、不里两个不服气，起而骂座，言辞极为恶毒。
拔都闻言，非常生气，他写了一封奏章，上报窝阔台大汗。窝阔台闻奏震怒，传旨说，今后不许贵由觐谒。
在场的蒙哥和阿勒赤歹（成吉思汗弟合赤温之长子）等人对窝阔台说：“成吉思汗在日曾有言‘军旅之事断于外，家中之事断于中’。贵由等人的事情属于军旅，应由拔都判决为宜。”
这几句话说得很得体，一来不致使窝阔台为处分贵由为难，二来也给足了拔都面子。窝阔台采纳了蒙哥二人的意见，把贵由交给拔都处理。
作为西征统帅的拔都心想：我总不能为此口舌之争而重罚皇太子贵由吧？既然大汗给了我一个台阶下，不如见好就收。因而拔都只是让贵由当着叔叔们和诸兄弟的面，赔礼道歉完事。但由此开始，贵由和拔都结下了深仇。
1241年11月窝阔台病死后，他的皇后乃马真氏临朝称制四年，两度发兵攻打南宋。1246年，乃马真氏还政于儿子贵由，是为大蒙古帝国第三代大汗。
贵由上台后，插手察合台家族的内政，迫使迫使察合台长孙哈剌旭烈让位于也速蒙哥，引起了哈剌旭烈的不满。在西征中与贵由不和的钦察汗拔都反对贵由继承大汗位置，两人结下冤仇。
1248年3月，贵由亲率大军准备攻打拔都，在离开和林西进叶密力的途中，突然病死，从而避免了一场皇室内部自相残杀的争战。
按照惯例，新汗未被推举出来之前，蒙古汗国的事务由皇后掌管。于是贵由汗的长妻斡兀立海迷失皇后抱着幼小的失烈门临朝称制，对于这种情形，无论是拔都还是拖雷家族，在刚开始的时候都是表示了默认的。
然而海迷失皇后并没有婆婆脱列哥那的本事，她只知沉迷于巫术，根本弄不明白什么叫做权力斗争。别说有效管理宗王大臣，就是自己的亲生儿子忽察和脑忽，她都管不过来，这两个宝贝王爷都想当大汗，都对军政指手划脚。
因而蒙古汗国在相当一段时间内，竟出现了母子三人都自认为是帝国的我最高首领、并且各自为政的情形。
历来蒙古汗国的统治者们治理国家的方法本来就是崇信武力可以解决一切，一言不合就喊打喊杀的，如今又成了这样一个局面，后果可想而知。
在海迷失统治的三年间，诸王争权，连遭天灾，国内一片混乱，幅员辽阔的蒙古帝国岌岌可危。没多久，蒙古宗王们就对海迷失皇后母子极度不满。
窝阔台系的威信彻底破产，相反拖雷家族的势力却在不断上升，大汗的位置看来要轮到这一脉了。蒙古诸王中年纪、身份、兵力都首屈一指的术赤系宗王拔都威信最高，他积极倡议公选新的大汗，一是为了自己家族的稳定，二是为了整个帝国的团结。
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