上书呈递给皇帝后，皇帝高度重视。他深知太医院的重要性，容不得半点马虎。皇帝立即下令，召集周权等相关势力代表进宫问话。金碧辉煌的宫殿内，气氛凝重得让人窒息。皇帝威严地坐在龙椅上，目光如炬，将上书重重地拍在桌上，怒声质问周权：“周权，你可知罪？竟敢妄图干预太医院事务，安排毫无医术之人进入管理层，你将皇族和百姓的健康置于何地？” 周权吓得脸色苍白如纸，双腿发软，“扑通” 一声跪地。他起初还试图狡辩：“陛下，臣冤枉啊。臣只是想为太医院引入新的活力，节省开支，并无他意。” 皇帝冷哼一声：“哼，还敢狡辩！林羽和院正呈上的证据确凿，你还想抵赖？” 在皇帝的严厉追问下，在林羽和院正呈上的铁证面前，周权最终不得不低头认罪，瘫倒在地。皇帝大怒，下令将周权等人暂且关押，听候处置。
处理完此事后，皇帝责令林羽和院正对太医院进行内部整顿。林羽和院正深知任务艰巨，他们决定从完善管理制度入手。首先，重新修订太医选拔制度。理论知识考核中，涵盖了中医经典如《黄帝内经》《伤寒杂病论》等的深入理解，药理知识要求太医们对每一味药材的特性、功效、炮制方法都了如指掌。临床实践考核时，设置了模拟病症，让太医们在模拟环境中准确诊断并制定治疗方案，同时要求他们在实际患者诊疗中展现出精湛的医术和冷静的判断力。医德医风考核通过患者评价、同事互评等多种方式进行，确保每一位太医都能秉持医者仁心。在晋升制度方面，建立了透明的晋升体系，医术水平通过实际治疗效果、疑难病症的攻克情况来体现；科研成果鼓励太医们积极探索新的治疗方法、研究新的药方；患者满意度则通过患者的反馈来衡量。杜绝任何形式的裙带关系和不正当竞争，让真正有能力、有医德的太医能够脱颖而出。
为加强对权力的监督和制约，太医院设立了独立的监督机构。该机构由几位德高望重、刚正不阿且医术精湛的资深太医组成。他们肩负着监督太医院管理层决策的重任，对日常工作进行严格审查。一旦发现违规行为，立即启动调查程序。同时，制定了详细的监督流程和严厉的处罚措施。对于违规操作的太医，视情节轻重给予警告、罚款、暂停行医直至开除等处罚。此外，建立了信息公开制度，定期将太医院的财务收支、药品采购、人事任免等信息向全体太医公布，接受大家的监督。从此，太医院的每一项工作都在阳光下进行，杜绝了暗箱操作的可能。
在选拔重要职务人员时，林羽和院正发起了公开竞聘活动。他们在太医院内张贴了醒目的公告，鼓励有能力、有担当的太医积极参与。竞聘过程包括提交个人业绩报告，详细阐述自己在医术提升、患者救治、医学研究等方面的成果；进行专业技能测试，考察太医们在诊断、治疗、药理等方面的专业水平；参加面试，由多位资深太医组成评审团，对竞聘者的综合素质进行评估；案例分析环节，让竞聘者面对复杂的病例，提出自己的诊断思路和治疗方案。通过层层筛选，选拔出了一批忠诚、有能力的太医担任重要职务。其中，医术精湛、在疫病治疗中表现出色且为人正直的赵宁，成功竞聘为太医院医政司司长。赵宁在就职仪式上，神情庄重，郑重承诺：“承蒙院正和林太医的信任，我定当竭尽全力，管理好医政司，为太医院的正常运转贡献自己的全部力量。”
在林羽和院正的不懈努力下，太医院逐渐恢复了往日的正常秩序。太医们的工作积极性大幅提高，他们不再为权力斗争所困扰，而是专注于医术的提升和患者的救治。太医院内，学术氛围浓厚，太医们相互交流、相互学习，共同为医学的发展贡献力量。林羽深知，虽然此次成功抵御了权力的入侵，但未来，太医院仍可能面临各种挑战。然而，他坚信，只要太医院上下一心，坚守医者的初心和使命，不断完善自身，就一定能够守护好太医院这片医学的净土，为皇族和百姓的健康保驾护航。
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