（2-6,7-9,10,11集数量不同，注意10,11集主角团队和太郎丸的表现也不同，第7集之后间奏切换的动画亦不同）
第2集之后同学变成了丧尸，第4集之后圭变成丧尸，第7-9集慈姐变为十字架、第10,11集变为丧尸，太郎丸10,11集消失。
第7集之后，学园生活部右下角慈姐被擦去，出现的照片变得较为压抑，鸽子的颜色亦有变化。
最后由纪脚下的颜色也逐渐变成血色（1-6,7-9,10,11颜色不同）
到第10集，由于雨天，丧尸大举进入教学楼，由纪走到窗边被雨水沾湿脸庞后意识到窗户碎了，似乎开始对真相觉醒。
第11集，在丧尸的大规模入侵的危急情况下觉醒，对美纪描绘了美好的前景，给了她前往地下室取解药，挽救众人的勇气。
但其后由纪又因为担心外出不归的美纪而带着球棒出动，在意念中慈姐的指引下前往广播室，看到了慈姐自我牺牲时留下的血迹，说出“再见，慈姐……”做了最后的告别。
第12集，前往广播室途中遭到丧尸袭击，尝试用棒球棒反击丧尸但完全没有效果，被丧尸化的太郎丸所救，之后用自己的帽子裹住太郎丸将它锁到柜子里。
在广播室发出放学广播，将聚集到学校的丧尸驱散，化解了危机。
随后，与学园生活部众人从学校“毕业”，毕业式中将头发扎成了萌萌哒短双马尾。
痊愈以后安然离世的太郎丸和由纪沾了血的帽子一同被埋葬在学校屋顶。
漫画剧情
学校早已被一群丧尸所包围，使得她的心理发生退行现象，犹如失忆般的活在正常生活的幻想之中。
之后因为慈姐的死使得症状更加恶化。
其余的成员们为了保护她，必须一边在与丧尸的对抗中生存下来，一边维持由纪正常学园生活的幻想。
但因为由纪即使在这样恶劣的环境依旧保持笑容，她已经不知不觉地成为了大家的精神支柱。
从胡桃被攻击后开始她的精神就开始恢复正常，直到21话做噩梦时完全恢复，但为了能让众人继续保持着那种开心轻松的状态，选择继续【扮演】着退行患者的角色。
然而，她和救济人格“慈姐”的互动已经越来越少了，也是从那时起她开始渐渐变得可靠起来。
但是当她逐渐恢复正常，变得可靠的时候，里姐的精神状态却迅速恶化。
原来里姐曾经有过一个叫“小留”（或译“小露”）的妹妹，但已经在一场发生在里姐面前的意外中丧生了。
里姐不断自责，心理防线崩溃，因此里姐一直把退行后表现幼稚而且依赖自己的由纪当成自己妹妹来抚平伤痕，掩饰真相。
由纪开始变得可靠对她没有正面效果，反而揭开了她心中的伤疤，让她的精神走向崩坏。
在众人进入鞣河小学，尝试寻找幸存者然而并没有发现，准备离开的时候，里姐却听见自己的妹妹小留为向众人呼救而发出声响。
在胡桃和由纪否认后却坚信是自己的妹妹小留在里面。
由纪觉察到了里姐的异常，临走前将一只小熊玩偶放进了楼里。
当天晚上，里姐果然悄悄离开了大部队，只身一人回到了小学，拾起了小熊玩偶并当成了妹妹小留，并对众人介绍自己的“妹妹”。
从此另外三人开始像当初对由纪做的那样，配合并维持着里姐的幻想。（刚好了一个，又疯了一个，太惨了……）
大学篇中察觉到了胡桃的夜行性，在发现胡桃再次在晚上失踪时被武斗派袭击并遭到控制，之后与学园生活部众人一同逃脱，并带头去寻找下落不明的胡桃。
后在丧尸群中找到了觉察到身体状况恶化，自暴自弃打算离开众人的胡桃，在得知胡桃的意愿后极力挽留，最终使胡桃决定回归学园生活部。
漫画后期解开了青袭椎子利用人工智能博曼留下的密码讯息，并由此得知了解药的真相，后和众人一起回到了巡之丘高中。
在美纪受伤，里姐牵制吸引丧尸的状况下，和慈姐、胡桃、青袭椎子的灵魂的指引下（胡桃明明没领便当……）成功找到了兰德尔保卫机构士兵留下的通讯机，并联络上了兰德尔公司阻止了核弹的发射。
这次是【真·广播救世】，随后与众人一同获救。
大结局中，三年后的由纪回到了巡之丘高中的废墟，成为了老师，并留着和慈姐一样的长发发型。
也在不断纠正小孩子不要叫她由纪姐（ゆきねえ）而是要叫丈枪老师，也算是圆了39话时留下的梦想。
（这似曾相识的一幕，感人的历史重演……(Ｔ▽Ｔ)
三年后的由纪甚至表现出了一边喝酒一边和幻想中的慈姐诉苦的社畜一面……
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