剩下的事情就很简单了，安德从NERV总部带走了初号机，还有一具绫波丽的身体，然后就带着弟子明日香，还有被他重新赋予人身的绫波丽回到了咖啡店。
与他一同跟来的还有葛城美里，这女人一直叫嚷着被他欺骗了感情，要好好找他算账，路上喋喋不休，大多是在骂安德如何如何渣，如何如何伤害她的感情之类的。
安德表示与我无关，然后根本不鸟她，把她气个半死。
现在情况就是这么个情况，安德吞噬了莉莉丝和亚当之后，使徒再也不是危险，而人类补全计划也彻底流产，就算是现在杀了安德，这个计划也不可能成功了，因为在前两者被吞噬之后，莉莉丝与亚当只剩下灵魂，一位彻底变成的人类绫波丽，而另一个渚薰也彻底降格，堕落成了介于人于使徒之间的存在。
这种降格是不可逆的，人类补完计划失去了成功的先决条件，从今往后摆在人类面前的就只剩下一条路，老老实实的攀科技树，别想着再整个大计划，了不起就是搞点战争的幺蛾子，但那已是与安德无关了。
有鉴于葛城美里太过唠叨，安德直接就没理她，让她一肚子火却没处发，然后一发狠，就学明日香的做法，直接在安德这儿住下。
然后安德依旧没理她，带着明日香和绫波丽就去了实验室，气的她想骂人。
对于家里多了个葛城美里，明日香是无所谓的，反正她又没办法抢走安德的爱，明日香所在意的是绫波丽，这个走后门的为什么会住在老师家里？而且老师还成了她的监护人？
对于这一点，明日香是非常在意的。
“老师，我是你的弟子吧？”
“嗯？”
“我可爱吧？”
“嗯？”
“我一直很乖巧吧？”
“嗯？”
“那我能不能提个小小的要求啊？”
“你想说什么？”
“把这个走后门的赶走怎么样？”
“你在想屁吃。”
“啊啊啊，老师我不喜欢你了，你伤害了我。”
“哦。”
安德进行着手上的工作，理都懒得理，然后明日香不爽了，就想去找绫波丽的麻烦，可惜后者是个三无，任由明日香如何说，绫波丽就是不理，更是气的明日香牙痒痒。
“身体年龄应该在三十二岁左右，相貌的话，跟绫波丽有七成相似，茶色头发，身高是多少来着？算了，就设定成176cm吧，至于碇源堂受不受得了，那就不是我的事了。罩杯……呃，算了，就这样吧，其余什么的，一切从简，至于他收到货会说我老婆怎么缩水了？那跟我有个毛线关系。”
没错，安德现在就是在催熟绫波丽的克隆人身体，将之改变成碇唯的模样，既然答应了人家再看到老婆的愿望，那就要说到做到。
做完这一切，安德就把初号机给拆了，拆的很彻底，直接将初号机的肉身粉碎，化成最精纯的lcl液，感受着其中那近乎消散的灵魂，他直接动用身为造物主的能力，将之补完，使之恢复到正常状态。
造物主的能力怎么说呢？对安德来说，就是奇怪的知识增加了，很好用，但也仅是如此了，并没有什么秒天秒地秒空气的能力。
碇唯的新身体，本身就是以她的基因为蓝本克隆出来的，所以与灵魂的契合度极高，加上安德的手段，成功将碇唯的灵魂放进了新身体中，然后就是等着其自然苏醒了。
毕竟是死了十多年的人，灵魂以量子状态存在于二号机体内，只有近乎本能的一些反应，要与新身体完全融合，这是需要点时间的。
好在这个时间并不长，不过大半天的时间，碇唯就醒了过来。
“嗯……”
营养槽中，碇唯睁开了眼，首先看见的就是抱着膀子的安德，还有身后的绫波丽与明日香。
“老师老师，她醒了呢。”
“我知道，都看见了。”
安德敲了敲营养槽的玻璃，吸引到了碇唯的注意，他道：“你的灵魂与新身体的契合度很好，恢复的也很好，不过因为这具身体是催熟的，所以最开始会显得很虚弱无力，一会儿我抽掉营养液，你不要有其他动作，能明白的话点下头。”
碇唯下意识点头。
她现在带着呼吸器，整个人都泡在营养液中，对于才复生的她来说，记忆还存在她在实验时候出了意外的最后一刻，现在完全不知道怎么一眨眼，自己就出现在了这里，还有那个人身后的淡蓝色短发的女孩是谁？为什么和我长的这么像？
安德按下按钮，营养槽里的液体迅速的被抽了出来，碇唯全身瘫软在其中，此时浑身无力，气喘吁吁的。
“明日香，去将衣服拿来。”
“哦。”
明日香闷闷不乐的将衣服拿了过来，虽然有点小性子，但不用安德吩咐，她就进入营养槽中将衣服给碇唯穿上了，然后抚着她坐上了专用的轮椅。
安德对其微微一笑：“我知道你有很多事情想问，但我不会跟你说太多，你想知道的，可以去问你的丈夫碇源堂，他会告诉你的，现在，我会将你送到他面前。哦对，还有你们的儿子碇真嗣，现在已经是个十四岁的小伙子了，我就不打扰你们的团聚了。”
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