南方联军中，态度暧昧、试图浑水摸鱼的几个州郡将领被罢职查办，其部队被责令即刻返回原防地。而几个谨守本分、及时约束部下的将领则得到嘉奖，并被赋予协助皇都周边秩序恢复、剿灭零星归源教残匪的任务。
镇北军少帅被赵战亲自召见（通过远程神识交流）。少帅详细禀报了北境黑风山异变、皇帝剑气出现及后续情况，并表达了镇北军上下对朝廷决策的疑虑与北境危局的担忧。赵战肯定了镇北军的忠勇，解释了部分内情（归源教阴谋及紫曜暗中干预），承诺将亲自处理北境问题，并厚赏了少帅及其部属，令其率军返回北境，加强戒备，等待后续支援。镇北军的疑虑稍解，军心渐稳。
对于皇都内部，清算更为细致。
李严及其“法理之剑”被彻底控制。赵战亲自探查了李严的神魂，发现了紫曜匿名晶片长期诱导的深刻痕迹，以及其理念极端化背后的人为催化。李严本人已陷入半疯癫状态，口中不断念叨“绝对法理”、“效率至上”。赵战废其修为，查抄其所有与不明来历的文书、器物（包括那诡异的金属箱），将其囚入天牢深处，以待后续与紫曜交涉时作为部分证据。其麾下“法理之剑”中，狂热追随者被清算，多数被蒙蔽者经甄别后编入其他部队或遣散。
澜涛王府被全面接管。那座地下实验场被赵战亲自封印，所有相关设备、资料、记录被封存。参与实验的卫士，幸存者得到太医院全力救治和朝廷厚恤，阵亡者追封厚葬，其家属得到优抚。赵澜的消失（与地脉灵性融合）被定为“为净化皇都地脉、守护国本而壮烈牺牲”，追封其为“忠勇护国王”，极尽哀荣。其王府属官、亲卫，经审查无大恶者，多数被吸纳进朝廷其他部门或军队。
朝中其他趁乱投靠李严或靖海侯、或消极怠工、甚至暗中与归源教有牵扯的官员，也被一一揪出，根据情节轻重，或罢免，或流放，或下狱。一时间，朝堂为之一清，但也空出了大量职位。
在肃清的同时，恢复与重建也在争分夺秒地进行。
户部、工部在龙骧卫监督下，全力开仓放粮，救治伤员，清理废墟，修复民居、衙署、城墙。赵战从“星骸”中分离出部分被混沌之力净化的纯净灵气，注入皇都几处关键的灵脉节点，加速地脉恢复，也为残存的修士提供了宝贵的修炼资源。
太医院与“天工营”合作，研制针对“蚀心引”后遗症和地脉污染造成疾病的药物与净化符箓，分发全城。
皇城司与重新整编的“靖安军”负责维持治安，搜捕残留的归源教奸细和趁乱打劫的匪徒，皇都的秩序以惊人的速度恢复着。
赵琰在太医的精心调理和赵战渡来的一缕混沌元气帮助下，伤势稳定下来，但修为跌落至金丹初期，且本源受损，需要长期静养。王定芬皇后从深宫中走出，以皇后之尊亲自抚慰伤亡将士家属，主持后宫，稳定内廷人心。
赵战的另外两个儿子——赵艳华与赵艳文（皆为赵战与月无痕所生），也随“破晓号”在数日后抵达皇都。赵艳华擅长灵光感应与安抚，立刻投入对受创百姓和修士的精神抚慰工作；赵艳文精于阵法与工造，则协助工部修复皇都防护大阵与重要建筑。兄弟二人虽不及赵琰身处漩涡中心，但也在这场浩劫中迅速成长，担当重任。
月无痕长老归来后，见阿月长老（她的姐妹/挚友）本源耗尽、陷入不知岁月的沉眠，悲痛不已。赵战以混沌之力助其稳固伤势，并承诺必将寻得唤醒之法。月无痕遂暂留皇宫，协助稳定朝局，并负责整理研究赵战带回的关于紫曜与上古遗骸的信息。
短短十日，皇都这个刚刚经历灭顶之灾的巨人，在赵战归来后的铁腕与高效下，勉强止住了流血，包扎了伤口，开始摇摇晃晃地重新站立起来。然而，表面的秩序之下，是国力的大损，人心的余悸，以及无数亟待解决的难题。
而最大的难题，已经来自星空之外。
第三节 紫曜通牒
皇都秩序初步恢复后的第十二日，一份特殊的“信件”，跨越无尽星空，无视了皇都外围尚未完全修复的防御阵法，如同幻影般，直接出现在乾元殿中，悬浮在赵战（星骸形态）面前。
它并非实体，而是一道高度凝练、结构复杂到极致的灵能讯息束，外层包裹着冰冷的银色光辉，散发着与紫曜观测站如出一辙的、绝对理性的秩序波动。
讯息束自动展开，化为一片光幕，上面浮现出赵战能直接理解的文字与图像。内容措辞“礼貌”而冰冷，逻辑严密，不带任何情感色彩：
致：大岐文明最高执政个体，赵战陛下
发自：紫曜联合观测理事会，秩序仲裁厅
事由：关于‘归寂星渊’异常事件及潜在禁忌力量扩散风险的初步调查与交涉邀约
正文：
根据《泛星系高等文明观察与互助基础协议》（即‘基石协议’）衍生条款，及《上古高危禁忌遗留物监控与处置共同准则》，本厅对近期发生于‘归寂星渊’区域（坐标：XXX.XXX）的能量异常事件进行了远程监测与初步分析。数据显示，该事件涉及：
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