“呱呱。”
“嗯，……呱呱泡蛙你怎么在这里？”
因为并没有像原动画受伤，博士听到呱呱的声音，往低头往下看了一眼。说道。
紧接着惊讶。
“我们很担心你呢，因为你的训练家联系到我们了，说你直接抛弃她，一走了之了”紧接着无奈道:“你还是老样子，又把自己的训练家抛弃了，算上这次起码有五次了吧？”。
“呱呱。”呱呱泡蛙毫不在乎的回答道。
就在这时，一位女助理赶了过来。
“博士，呱呱泡蛙的训练家说不要他了，并说道既然你一走了之，那我就不要你了。并通过机器从我们这选了火狐狸”
然后小智讲述自己和呱呱泡蛙的事。
听完小智的话，博士若有所思。
博士跟众人讲述了这只呱呱泡蛙的故事。众人便明白，他本来是供新人训练家培养的神奇宝贝，但是他很奇怪，有时在战斗中不听指挥，自主战斗，甚至主动抛弃训练家。
“要不然，你收下这只呱呱泡蛙吧。”博士提议道，因为博士觉得呱呱泡蛙总是抛弃训练家，可能是觉得他们不够格，而小智身为一个强大的训练家，可能可以培养好呱呱泡蛙。
“真的吗？＂小智惊喜的问道。
＂是的。”博士也很无奈，竟然会有这么有个性的呱呱泡蛙。
随后把精灵球交给了小智。
随后，博士带着三人参观了研究所。
来到宝可梦居住的地方，袖丽嘉很高兴，跟神奇宝贝一起玩耍。
博士接着介绍关于还在研究的超进化，这种特殊的进化需要石头的加持，以及精灵和训练家强大的羁绊，才能短时间到达这种状态。
而火箭队则正在上面偷听着并打算谋划，就在这时，果然翁冒了出来，刚想开口，便被三人组制止了。
随后，三人组经过伪装，打开了研究室的大门，说自己是研究超进化的。
烈咬路鲨赶了过来，看到有精灵到来，小次郎拿出一个道具，武藏则把一个工作人员推开，接着小次郎把道具扔了过去。
形成一个项圈，控制住了烈咬陆鲨，然后拿出一个仪器操作着什么。
小智感应到了那熟悉的波动，派出了拉帝亚斯，纵身一跃，跳在她的背上，直接赶了过去。
看到了伪装的三人组和烈咬路鲨。
烈咬陆鲨脖子缠着一个项圈吐出暗紫色的光线，四处破坏着，把周围搞得一团糟。
博士也听到动静也赶了过来问道:“你们是什么人？＂
三人组则进行说开场白还没说几秒。
“使用念力把那三人打飞出去，在使用急冻光线冰冻住烈咬路鲨。”小智就直接动手了。
随着念力的作用，三人组化作流星飞了出去，“好讨厌的感觉x3。”
接着，拉帝亚斯从嘴中吐出冰蓝色的光线，与暗紫色的光线对拼，直接压过去冻住了烈咬路鲨。
看到冰冻住的烈咬陆鲨，小智走过去运用波导之力粉碎了一部分冰块，一个手刀把项圈打碎了，接着，运用常磐之力进行治疗，绿光在他的手上浮现。
其他人被小智的操作震惊到了，说不出话来。
博士看这种情况下想到以前了解过:“这是常磐之力吗？”
与此同时，莎莉娜受不了铁甲犀牛的训练了，打算出去旅行躲一躲。
解决完火箭队的搞乱后，博士递给了小智神奇宝贝图鉴，然后在呱呱泡蛙的要求下，小智收服了呱呱泡蛙，意味着小智也收服了在卡洛斯地区第一只神奇宝贝。
接着小智三人朝着神奇宝贝中心走去。
来到目的地后，小智递出了自己的神奇宝贝图鉴交给乔伊小姐:“乔伊小姐，拜托帮助我登记卡洛斯联盟。”
乔伊小姐将图鉴接入电脑，随后胖可丁递来了徽章收集盒。
与此同时，三人组找了一个地方跟着坂木老大进行联系。
看着传来的板木老大的影像，喵喵率先开口道:“我们到达卡洛斯地区。”然后三人组聊着宏图大业。听完三人组的报告，板木对他们进行表扬，并希望他们在卡洛斯地区加油。
听到板木老大的夸奖，三人组兴奋了起来，让周围的人莫名其妙。
而小智则跟大木博士打起了电话，分享了自己收服的第一只卡洛斯精灵。
希特隆带着小智去四号道路来到白檀市，俩人也打算跟着小智一起去旅行。
而莎莉娜穿着新衣服跟母亲和铁甲犀牛告别，出门了。
小智三人经过漫长的旅行进行原地休息。为神奇宝贝做着护理。
小智用毛巾给拉帝亚斯做护理
袖丽嘉抚摸皮卡丘，让他发出舒服的叫声，突然出现了咚咚鼠。
好可爱，哥哥收服她吧。看着这只老鼠的出现妹妹建议道
就在这时，小箭雀冒了出来，抢走了咚咚鼠的果子并吃掉了。让咚咚鼠眼冒眼泪的跑开了。
看到伤心的咚咚鼠，呱呱泡蛙决定为他报仇，使出呱呱泡沫打向小箭雀。
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