然而，失去财阀支持的提坦斯被彻底打残，在决战中，投入全部兵力背水一战的提坦斯不计后果的攻击新吉翁，基西利亚战死，吉翁第二公国被推翻，吉翁第二共和国成立。
扎比派被突入side3的提坦斯士兵血洗，仅有年仅11岁的密涅瓦扎比在基西利亚亲卫队的保护下出逃，前往火星圈避难。
因为提坦斯被解散，联邦军羸弱，地球圈治安急速恶化。
联邦军组织精锐士兵以及整编提坦斯幸存者，以明星舰长布莱德诺亚以及战争中涌现出来的新人类驾驶员为核心组建了地球联邦治安维持部队“隆德贝尔”。
在死亡商人阿纳海姆电子工业以及地球超大型财阀罗氏商会的支持下，隆德贝尔迅速发展，宇宙舰队的规模甚至达到了四只整编舰队的程度。
0093年，卡斯巴尔·戴肯（旧吉翁军明星军人夏亚阿兹纳布）回归side3殖民地“甘泉”，发表演讲，在有心人的支持下于“甘泉”成立新国家“NEO吉翁”。
同年，第三次新吉翁战争（又称夏亚之乱，一周战争）爆发，夏亚试图把小行星阿克西斯坠落地球，倒逼地球居民全部移民宇宙。
借此来一举抹平地球居民和宇宙居民之间的鸿沟。
这次战争在一周内被平息，NEO吉翁舰队被六倍以上的隆德贝尔舰队围殴，超级王牌驾驶员夏亚被捷多、卡缪、阿姆罗、拉拉辛四人围殴，坚持了30分钟后被击坠战死，阿克西斯进入坠落的最终阶段，阿姆罗等新人类驾驶员试图使用MS将阿克西斯推离地球。
因为种种原因，四台新人类专用MS的精神力骨架暴走，引发奇妙发光现象，阿克西斯被推离地球圈，进入安定轨道。
阿姆罗、拉拉辛机下落不明，卡缪遭遇精神污染昏迷，捷多亚西塔全身而退，并在0094年于side7偶遇一神秘粉色头发新人类女子，次年两人成婚。
当年，因为女子杰出的新人类才能以及其他才能，破例加入隆德贝尔。
在隆德贝尔有意无意的养匪自重下，NEO残党时不时地出来秀一下存在感，屠刀时不时地在联邦高官的脖子上抹一抹，这让深感威胁的联邦高官不断的主动给隆德贝尔追加经费和新机体。
比如，基本康复的卡缪开上了Z系列的后继机，捷多开上了ZZ系列的后继机，自称米娅·亚西塔的贼能打的参谋开上了综合了卡碧尼、精神力高达、吉翁号、海牛高达等新人类专用机技术开发出来的新型新人类专用机。
然后……时间一晃到了0096年六月……
暗礁宙域周边约1300公里处，隆德贝尔第三舰队所属的克拉普级轻巡洋舰拉·克希尔号上。
“战斗配置…转换太慢了！都在干什么！”
“主炮威慑射击！逼停前方的高速货船！”
“MS队出动，包抄拦截敌舰，允许有限开火，击破敌舰引擎。”
“亚西塔少校，和情报一样，有伪装货轮来到了这条航线上。捕获敌舰的任务就拜托了。”轻巡的舰长低头看着私人通讯的画面。
“鬣狗想抛开饲主偷吃啊……”捷多·亚西塔戴上驾驶服的头盔。“是阿纳海姆干的好事吗？”
“传说阿纳海姆的所有者，比斯特家的祖宅在一年战争之后搬到了这个新开发的工业殖民地“工业七号”里，不过这都是谣传啦。
因为“蜗牛”（殖民地建造装置）的存在，那个殖民地一直处于建造中的状态，很难进行精确测定。”舰长耸了耸肩膀。“不过类似的传言还有一大堆，天知道哪个才是真的。”
“但是neo吉翁要去那里接头，接收名为拉普拉斯之盒的不明物体，起码这些传言不是空穴来风。”捷多穿好驾驶服手套。“捷多亚西塔，ZZ高达MK5离舰。”
“捷多哥哥，neo吉翁的机体击坠就行了吗？”一名橘黄色头发的少女一边和捷多通话，一边钻进自己的机体里。
“无所谓，这不是重点。”
“了解~”少女撇了撇嘴。随后，控制机体缓缓走向弹射器。“普露39，精神力高达mk4，离舰。”
于此同时……
——被追击的neo吉翁伪装货船——
“引擎最大，紧急加速，左舵17，直接冲进暗礁宙域里。”舰长从通道中钻了进来，翻身做到舰长席上，整理着宇航服。“米诺夫斯基粒子散步至战斗浓度。”
“炮击袭来！”
“规避运动，封锁隔离闸门。”舰长拉过来自己的控制面板，开始分析局势。
“推测敌舰为克拉普级巡洋舰。”
“高能量体射出，推测为MS，数量2，不5台。”
“让玛丽坦出动，无视母舰，凭借格兰雪号的速度足以甩开。”舰长下意识的下令。“数量不少，没问题吧？”
“了解，Master。”同样是橘黄色头发的但是看起来更成熟一点的女青年戴上头盔，冷漠的回复到。“目标捕捉，两台机体热源反应很大，推测是特务机。”
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