古菌界之主要古菌门中广古菌门:
广古菌门(Euryarchaeota)是古菌界(Archaea)中的一个重要门类,包含多种代谢类型和生态分布多样的类群。根据现有的分类系统(如GTDB、NCBI Taxonomy等),广古菌门下的纲级分类如下(截至2023年更新):
广古菌门(Euryarchaeota)的主要纲:
1. 甲烷杆菌纲(Methanobacteria)
产甲烷菌,严格厌氧,常见于湿地、肠道等环境。
例:Methanobacterium。
2. 甲烷球菌纲(Methanococci)
部分为嗜热产甲烷菌。
例:Methanococcus(如深海热泉中的 Methanococcus jannaschii)。
3. 甲烷微菌纲(Methanomicrobia)
多样化的产甲烷菌,包括利用氢和二氧化碳或乙酸的类群。
例:Methanospirillum。
4. 甲烷火菌纲(Methanopyri)
极端嗜热产甲烷菌。
例:Methanopyrus kandleri(生长温度可达122°C)。
5. 盐杆菌纲(Halobacteria)
极端嗜盐菌,需高盐环境生存。
例:Halobacterium salinarum。
6. 热原体纲(Thermoplasmata)
嗜热嗜酸菌,无细胞壁。
例:Thermoplasma、Picrophilus。
7. 热球菌纲(Thermococci)
超嗜热厌氧菌,常见于热液喷口。
例:Thermococcus、Pyrococcus。
8. 古球菌纲(Archaeoglobi)
超嗜热硫酸盐还原菌。
例:Archaeoglobus fulgidus。
9. 甲烷嗜高热菌纲(Methanothermobacteria)
高温产甲烷菌。
例:Methanothermobacter。
泉古菌门(Crenarchaeota)是古菌界(Archaea)的重要门类,主要包含嗜热、嗜酸或嗜中温的类群,广泛分布于高温环境(如热泉、深海热液)及海洋、土壤等。根据最新的分类系统(如GTDB、NCBI Taxonomy等),泉古菌门的纲级分类如下(截至2023年):
泉古菌门(Crenarchaeota)的主要纲:
1. 热变形菌纲(Thermoprotei)
最经典的泉古菌纲,包含大多数极端嗜热菌,形态多样(杆状、丝状等)。
代表类群:
Thermoproteales(如 Thermoproteus)
Sulfolobales(嗜酸嗜热菌,如 Sulfolobus)
Desulfurococcales(超嗜热菌,如 Pyrodictium、Ignicoccus)
2. 硝化球菌纲(Nitrososphaeria,原名Thaumarchaeota)
重要更新:根据基因组研究,原奇古菌门(Thaumarchaeota)被并入泉古菌门,作为Nitrososphaeria纲。
多为中温菌,参与氨氧化(氨→亚硝酸盐),广泛分布于海洋、土壤。
代表属:
Nitrosopumilus(海洋氨氧化古菌)
Nitrososphaera(土壤氨氧化古菌)
3. 热丝菌纲(Caldisphaeria)
嗜热菌,分离于酸性热泉。
例:Caldisphaera lagunensis。
4. 火裂菌纲(Pyrodictiaceae)
部分分类系统将其归入Thermoprotei纲下的目级(如 Pyrodictiales)。
超嗜热菌,形成独特的网络状细胞结构。
例:Pyrodictium occultum(生长温度可达110°C)。
5. 未培养类群
如Candidatus Korarchaeota(部分基因组证据支持其与泉古菌的亲缘关系,但分类地位仍有争议)。
截至最新的分类研究(如GTDB 2023或NCBI Taxonomy),奇古菌门(Thaumarchaeota)的分类地位已发生重大调整——不再作为独立门级分类单元,而是被并入泉古菌门(Crenarchaeota),作为其下的一个纲(硝化球菌纲,Nitrososphaeria)。以下是详细说明:
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